《代号：A.i.》是一款融合了奇幻废土与蒸汽幻想元素的放置游戏。第二次魔物之潮已经过去了几百年。大陆和平已久，诸王们耽于安乐，相互争夺权力，将黄金填满自己的地库。然而，就在人类放松警惕的时刻，第三次魔物之潮席卷了大陆。土地荒芜、城市废弃，世界陷入混乱。传说中只有世界之树才能庇护人类。

一片废墟中，失去记忆、手握断剑的“我”邂逅了贵族少女赛茜莉亚，组成了属于自己的公会，并幸运地找到了一株世界之树。是然而这可能是唯一的一棵世界之树，它本应该护卫人类，现在却正在逐渐枯萎。借助世界之树旁的飞艇，以世界之树为基地，“我”开始了一边抵御魔物之潮帮助幸存的人类，利用战利品增强公会的整体实力，一边寻找记忆的冒险之旅……